Willem’s praktijk bestaat hoofdzakelijk uit procederen op het gebied van het intellectuele eigendomsrecht. Willem treedt op voor alle nationale gerechten (in eerste aanleg, hoger beroep en voor de Hoge Raad). Daarnaast procedeert Willem regelmatig bij het Hof van Justitie van de Europese Unie en bij het Europees Octrooi Bureau (EOB).
Willem houdt zich verder bezig met het adviseren omtrent Europese octrooistrategieën en het coördineren en voeren van Europese octrooigeschillen. Hij is de adviseur van verschillende innovatieve Nederlandse en buitenlandse multinationals, waaronder farmaceutische en biotechnologische bedrijven.
Willem is ook professor Intellectueel Eigendomsrecht aan de Universiteit van Tilburg.
Hij is één van de oprichters van HOYNG ROKH MONEGIER, was managing partner van het kantoor van 2011 tot 2015, toen HOYNG MONEGIER krachten bundelde met het Duitse kantoor ROKH IP en trad af als managing partner in januari 2018.
Willem maakt deel uit van een selecte groep advocaten die zijn toegelaten tot de Hoge Raad der Nederlanden.
Hij is voorzitter van de Adviescommissie van het Gemeenschappelijk Octrooigerecht (UPC), was lid van de redactiecommissie van het Reglement voor de procesvoering van het UPC en adviseert ook het Nederlandse Ministerie van Economische Zaken over UPC-aangelegenheden.
Willem Hoyng heeft in het rechtsgebiedenregister van de Nederlandse orde van advocaten de rechtsgebieden Intellectueel eigendomsrecht en Cassatie als hoofdrechtsgebieden geregistreerd. Op grond van deze registratie is hij verplicht elk kalenderjaar volgens de normen van de Nederlandse orde van advocaten tien opleidingspunten te behalen per hoofdrechtsgebied.